borrar fichero al cerrar una ventana

[Panino5001]

No sería confiable hacerlo con js. Lo que podrías hacer es algo semejante a un sistema de control de usuarios activos, que consiste en asignarle a cada usuario un identificador y guardarlo en una base de datos junto con la hora, y en cada petición que se hace actualizar ese dato en la base de datos, borrando de la misma los que no hayan tenido actividad en x tiempo. Podrías hacer eso, y al mismo tiempo que borrás el dato en la base de dato tras ese período de inactividad, borrar el fichero asignado al usuario.