Hola, no entiendo bien tu pregunta no se si te refieres a esto:
Código PHP:
echo "<td><input type='text' name='calif' size='5' value='".$row[4]."' maxlength='5'></td>";
Si ya tienes guardado el nombre y el apellido, lo que tienes que hacer es actualizar el campo donde guardas las calificaciones
Saludos