Solo un dato importante, si aún no tienes el Flash SC3, procura hacerlo todo de corrido en la linea de tiempo, no con animaciones dentro de Movie Clips... Eso le llega a causar errores a la hora de exportar al Flash, ve probando poco a poco.
(no tengo ese Flash, pero se dice que las nuevas características permiten un correcto exportado a película aún usando Movie Clips
)