Vas a tener que imprimirlo en el documento como si fuera código js:
Código PHP:
echo "<script>";
echo "miArray=new Array()";
echo "miArray[0]='".$arrayPHP[0]."'";
echo "miArray[1]='".$arrayPHP[1]."'";
Y así conseguirás tener el array de php $arrayPHP en el array miArray de javascript.
Un saludo.