Muchas gracias por sus respuestas.
Tozani cuando escribes 
 Cita:  Mi recomendacion es que loggees las consultas de las paginas que se tarden mas.
    ¿A que te reiferes?  
cuando escribes:  
 Cita:  Asi que en esa situacion de alto trafico tal vez tengas un cuello de botella en la cantidad de threads disponibles de apache o en la cantidad de conexiones a MySQL.
    Como puedo darme cuenta que es ese el problema y cual es una posible solucion, teninedo cuenta que estamos en un servidor dedicado por tanto podemos cambiar la configuracion del apache como queramos. 
Gracias!!