No sé como andas de inglés pero en esta dirección hay un manual de migración de versiones de IIS a IIS6.
http://technet2.microsoft.com/windowsserver/en/library/722ec2f4-06e7-41ab-8f07-3475cf5cc5511033.mspx?mfr=true
En lo referente al problema con las sesiones a qué te refieres exactamente?
Un saludo