Hola
Código PHP:
if ($result = mysqli_query($link, $query)) {
$c=mysql_affected_rows();
$A[$c];
$B[$c];
$c=0;
while ($row = mysqli_fetch_row($result)) {
$A[$c]=$row[0];
$B[$c]=$row[1];
$c++;
}
/* free result set */
mysqli_free_result($result);
}
Asi tendrias todos los resultados de un campo en el primer array "A" y todos los resultados del otro campo en el segundo array "B".
La variable $c en un principio guarda la cantidad de resultados devueltos por la consulta, para pedir espacio en los array unicamente para la cantidad que necesitas, y despues la utilizas como contador para poder ir moviendote por el array con cada ciclo del bucle.
No se si era eso a lo que te referias, espero que te sirva.
Saludos