axe, la verdad es muy extraño. No se me ocurre cual sería el motivo para que tu máquina sea responsable
Si a la ventana le estás dando tamaño mediante el link que la abre podrías probar cambiar clientWidth / clientHeight por innerWidth / innerHeight????
Funcionar, funciona igual... ahora no se si en tu navegador arreglará algo, pero... podrías probarlo.
Cita: <script>
function centrar() {
iz=(screen.width-window.innerWidth) / 2;
de=(screen.height-window.innerHeight) / 2;
moveTo(iz,de);
}
</script>
Si le encontrás solución comentalo.
Saludos!