Hola.
si te refieres a que no se vean la barra de menu y la de vínculos, tan solo tienes que incluir este código javascript a algun evento... ej. onclick.
window.open('pagina.htm', 'pubpopup', 'toolbar=0,location=0,status=0,menubar=0,scrollbar s=1,height=140,width=468')
y como verás tambien puedes configurar otras opciones para tu popup.
saludos.
