Como te va a ir? estas dentro de php, y vuelves a abrir php, xD
<?php
$base_cuerpo = <<<HTML
<h3>Configuración</h3>
<div class="mensaje">$_GET[mensaje]</div>
HTML;
?>
Y no hace falta un echo, por que, el valor de la variable $_GET['mensaje'] ya lo estas metiendo en la variable, ya se mostrara cuando le agas un echo a $base_cuerpo, y despues, no se pone $_GET["mensaje"], por que, cuando pones una variable que esta dentro de un array, si ya esta entre " ", no se le pone " " a la palabra, en este caso no esta entre " ", pero, el metodo que utilizamos lo que hace es imitar las comillas, a si que la variable $_GET[mensaje], en este caso tiene que ir sin comillas, igual que cuando lo utilizamos para un condicional de uan consulta.
Un saludo