Problemas con tiempo de ejecuion de script

[damito]

Hola a todos, tengo un script que se ejecuta por el cron del servidor, pero no llega a terminar y el mensaje que recibo es de "time out", en la configuracion del servidor el valor max_execution_time es de 7200, y en mi script puse set_time_limit en 10000, pero no llega nunca a ese tiempo.

Alguien tiene idea cual puede ser el problema?

Gracias