Pues sí es otro soft que baja los videos de los servidores mencionados. Según dice su web que permite bajar desde más ubicaciones, y más tipos de archivo, he probado el último VDownloader que salió, y a destacar esta su buscador interno con previsualizaciones, eso ahorra tiempo a pasto, pero este otro habrá que revisarlo...
Sobre lo de bajar el flv, pues, notodos los videos estan en flv, pero los que estan, o los convertes a un formato estándar o utilizas un reproductor de flv como el Riva, depende para que los necesites y qué tantos programas necesites instalar para ver los videos en los formatos originales, a mi gusto convertirlos a un formato estandar es lo ideal, aunque debes tener algo de buen ojo para saber a qué formato/codec cambiarlo, por cierto, esta última versión del vdownloader tiene más opciones para codificar.