duda con base de datos

[Mahalo]

Bueno, es simplemente una consulta y recorrer los resultados a la vez que actualizas la tabla.
Usa esta consulta:

SELECT id FROM tabla ORDER BY TP_PTPS DESC;

El id no sé si lo tienes en la tabla, es para la referencia de actualización.
Como vendrán ordenados de mayor a menor, crea una variable que empiece por cero y la incrementas con cada registro.

$variable++;
$actualiza = "UPDATE tabla SET rut=$variable WHERE id=$registro->id";

Saludos!