No es al imprimir un texto sino cuando imprimo una sentencia como esta la cual me arroja problemas con las comillas.
Esta es:
<td align='center'> <a href='motivoInasistencia.php' target='_blank' onClick= " window.open(this.href, this.target, ' width=200,height=300 ' ); return false; " > Click Aquí </a> </td>
es donde empieza el windows hasta false; las comillas dobles y las simple desde width hasta 300.
Al colocar esto en php ocurre errores, como lo puedo hacer para no tener problemas de sintaxis en php.