Lo que pasa es que el logout.php lo tienes en un directorio diferente y, entonces tienes que especificar el path donde la cookie va a estar disponible, si especificas como "/" estará disponible en el dominio especificado, es decir, en todos tus directorios. Ejemplo:
para establecer la cookie:
Código PHP:
setcookie("pabadpass", $pass, time() + 3600, "/", tudominio.com);
y para eliminarla
Código PHP:
setcookie("pabadpass", "", time() - 3600, "/", tudominio.com);
si estas trabajando localmente puedes substituir tudomino.com por localhost, o el nombre que le hayas puesto.