Buenas.
Yo solo te recomendaría no mezclar sistemas de usuarios y sistemas de administración. Te puedes llevar un disgusto cualquier día, y, en tu caso, menos mal que era alguien de confianza, que si no te hace un apaño.
Otra cosa que pudieras hacer, es no usar las mismas variables de sesión en los sistemas, así no tienes problemas de ese tipo.
Respecto a tu pregunta, la verdad es que nunca me lo he planteado, así que no sabría decirte.