Hola:
Las ventanas modales (alert, confirm y prompt) no pueden modificarse, pero pueden modificarse algunas capas para que simulen ese tipo de ventanas (no te lo aconsejo)... de todos modos no lo estás usando bien (me extraña que te funcione correctamente), deberías usarlo en el onsubmit del tag form... ¿te va bien en todos los navegadores o se envía el formulario aunque pulses "cancelar..."?
Saludos
