Cuando trabajas con photoshop, debes guardar las capas en distintas imágenes, de fondo transparente (gif).
 
Las importas a flash: Archivo->Importar a biblioteca. 
Las metes de una en una en mc's distintos:
Insertar->Nuevo símbolo->Clip de película. 
Ahora estás en el modo de edición. Arrastras desde la biblioteca al escenario una imagen. Y repites este proceso con todas ellas. Acabas teniendo en la biblioteca tantos mc's como imágenes. 
Vuelves al escenario principal y colocas dichos mc's en él. A cada uno le pones un nombre de instancia diferente: por ejemplo 
img1, 
img2, 
img3,... 
Y ahora, necesitas un botón (nombre de instancia 
boton) para mostrar/ocultar las imágenes. Y en las acciones de fotograma de la línea principal: 
Código:
 boton.onRelease = function() {
   // para la imagen nº 1:
   if (_root.img1._visible) {
      _root.img1._visible = false;
   } else {
      _root.img1._visible = true;
}
  Saludos!