Eso sería puro html... agregale un salto de línea al final
Código PHP:
<?php
$resultado= mysql_query("SELECT archivo FROM boletin" , $cnx);
//asignas y recorres los posibles registros que pudo haber encontrado al cumplir la condición
while($row=mysql_fetch_array($resultado))
{
//los archivos estan enuna carpeta q se llama boletin
echo "<a href=\"boletin/$row[archivo]\" target=\"_blank\">$row[archivo]</a><br />";
}
?>