Parece ser que no explique bien mi problema, pero bueno ya da igual, dejo aqui la respuesta por si acaso le pasa a otra persona.
Los comentarios que se hacen en los campos de una tabla se guardan en otra base de datos de MYSQL llamada "INFORMATION_SCHEMA" así que si queremos extraerlos debemos hacerle una consulta a esa DB de esta forma:
Código:
SELECT COLUMN_COMMENT FROM COLUMNS WHERE TABLE_NAME = 'nombre-de-la-tabla' AND COLUMN_NAME = 'nombre-de-la-columna'
No lo intenteis en servidores contratados ya que no tenemos permisos para hacer consultas a esa data base ya que tiene mucha información.
Saludos y gracias por vuestra pequeña ayuda.