Emm... puedes hacerlo asi.
Código PHP:
<?php
$addStr = "";
$strNumero = "482";
$numMax = 5;
$larNumero = strlen($strNumero);
$diff = $numMax - $larNumero;
while($diff > 0){
$addStr = $addStr."0";
$diff--;
}
echo $addStr.$strNumero;
//output: 00482
?>