Ese tipo de subtítulos no están en un formato de texto, que es lo que admite el Subtitle Workshop, sino que están en formato imagen. Para convertirlos a formato texto necesitas usar un software OCR, el más utilizado sin duda es el SubRip. Te dejo un manual:
www.mundodivx.com/subtitulos/subrip.php
Una vez conviertas los subtítulos con este programa, podrás hacer lo que quieras con ellos en el Subtitle Workshop
Saludos