SAludos..
Te doy una idea de como podrias sacarlo
Código PHP:
//Haces tu query comun y corriente
$resulta = mysql_query($sqla, $con) or die(mysql_error());
//inicializas una variable en 0
i=0;
while ($line = @mysql_fetch_array($resultc)){
//guardas el reultado en un array
$idest[i] = $line['id_est'];<---Valor que saque de la primera consulta
i++:
}
// el resultado lo separamos por comas
$separado=implode(",",$idest);
$sql = "select @a:=@a +1 as `correlativo`,id_est,concat(nombre_est,' ',apellido_est) as 'nombre_completo' from alumno where grado = '$id_curso' and modalidad = '$id_modalidad' and id_sede = '$id_sede' and id_est NOT IN(".$separado.")";
<---Aqui paso el valor de la primera consulta para hacer la discriminacion
Bueno espero que te funcione...
Hasta Pronto!