Lo que te decia del ID AUTO_INCREMENT se pone en la tabla como un campo mas...
Si ya tienes creada la tabla y quieres agregarle el valor haz lo siguiente:
Código:
ALTER TABLE NombreTabla
ADD NombreCampo int(11) NOT NULL auto_increment;
Esto lo pones en tu mysql o en donde estes poniendo las consultas sql, reemplazando siempre NombreTabla por la tabla donde quieras poner el dato y NombreCampo por el nombre que quieras ponerle a ese campo y listo.
Suerte!