<div style="position:absolute">

[Escoffie]

Hola bichomen.

Si usas include de PHP, lo que tengas en tu página "hija" pasa a ser parte del DOM de la página "madre". Así que se rige por las reglas del DOm y del CSS como si fuera una sola página. ¿Me explico?

Luego entonces, el elemento que estás posicionando se está posicionando con respecto al View Port del navegador. No es que se esté colocando con respecto a la "madre".

Para que se posicione con respecto al elemento que lo contiene, es decir, con respecto al DIV donde tienes puesto tu include de PHP, a este DIV le tienes que poner div#fulano{position:relative;} y con eso le dices a tu menú que su posición será en relación al elemento que lo contiene y no con respecto al View Port.

Espero haberme explicado y que te sirva. Cualquier duda, pregunta, y si puedes, postea tu código.

Intenta esto: corre tu Script y copia y pega el HTML resultante. Verás que no hay páginas madres o hijas, sólo un DOM HTML.

Saludos.