Ejecución de script no muestra resultado

[spAlex]

Buenas a todos.
Es la 1ª vez que escribo es ente foro, así que saludos a todos.

Bueno, el problema que estoy teniendo me tiene un poco desconcertado. Os pongo en situación, a ver si alguien me puede echar una mano.

Tengo una aplicación ejecutándose en un servidor que lee de una bd MySql y realiza unas operaciones de resumen de unos registros de una tabla y muestra el resultado por pantalla, hasta aquí todo funciona bien.
El problema me surge cuando esta tabla crece en número de registros, que llega un momento en que la aplicación tarda mucho en ejecutarse, y finalmente, en el navegador pone "Terminado", pero la pantalla aparece en blanco.
Había pensado en que los cálculos eran la causa de esto, pero cual es mi sorpresa cuando ejecuto este mismo código en un servidor local en mi pc, tirando de la misma bd, y aquí tarda unos 3 mins aprox.
He revisado las estadísticas de rendimiento del servidor, y en ningún momento ni el procesador ni la memoria parecen resentirse por la ejecución de la aplicación.

He probado a forzar el vaciado del buffer de salida, pero no he conseguido nada.

A alguien se le ocurre alguna solución o prueba?
Muchas gracias a todos.