Lo que te está diciendo es que no existe la carpeta ../$sector/$tienda, y no podés crear nada dentro de una carpeta que no existe... tenés que crear todas las carpetas que faltan
Código PHP:
if (!is_dir("..\\$sector")) mkdir("..\\$sector");
if (!is_dir("..\\$sector\\$tienda")) mkdir("..\\$sector\\$tienda");
$mypath="..\\$sector\\$tienda\\MAPA"; // creando carpeta MAPA
mkdir($mypath,0777);
$mypath2="..\\$sector\\$tienda\\CATALOGO"; // creando carpeta CATALOGO
mkdir($mypath2,0777);
$mypath3="..\\$sector\\$tienda\\PANORAMA"; // creando carpeta PANORAMA
mkdir($mypath3,0777);