Hola,
En PHP es bien fácil, si la sustitución que necesitás es simple:
Código HTML:
<html>
<head>
<title></title>
</head>
<body>
<div align="center">
<br/>
bienvenido <b><?php echo $Usuario; ?></b>
</div>
</body>
</html>
y luego,
Código PHP:
include('Plantilla.html');
sería suficiente para que se mostrara lo que querés. En este caso, el "include" hace que php trate como texto al archivo incluido, y ejecute sus bloques de código PHP.
Te recomiendo que te pases por la
página del manual sobre include.
Saludos