Hola gz_pedro, una de las primeras cosas que hay que hacer cuando armas la base de datos es definir las claves principales y foraneas para armar las relaciones y respetar la integridad de las mismas, debes utilizar las tablas del tipo innodb para conseguirlo, mi consejo es que redefinas tus tablas y en sus debidos casos colocar indices donde correspondan para que tus consultas sean mas rapidas. Saludos
