Estas lineas:
Código PHP:
$query = mysql_query("SELECT permisos FROM users WHERE username = '$username'") or die(mysql_error());
$permiso = mysql_num_rows($query);
Deberias de ponerlas asi:
Código PHP:
$query = mysql_query("SELECT permisos FROM users WHERE username = '$username'") or die(mysql_error());
$row = mysql_fetch_row( $query );
$permiso = $row[0];
Saludos.