Bloquear documentos

[Ronyphp]

Hola nuevamente a todos, he escrito de nuevo ya que me he dado muchas vueltas para poder bloquear un carpeta o archivos, y no he dado como hacerlo e leido pero no entiendo ya que he buscado varios ejemplos de .htaccess, pero no consigo que me funcione, cuando escribo la ruta donde esta el .htaccess ejemplo:

www.mipagina.cl/intranet/link/.htaccess

en el navegador me muestra lo que tengo escrito dentro del archivo:

"Deny from all"

Tambien e intentado con este codigo pero pasa lo mismo que lo anterior:

<Files ~ "^.(htaccess|htpasswd)$">
deny from all
</Files>
Options Indexes
order deny,allow

En realidad ya no se que debo hacer.

Si por ahi hay alguien de buen corazon que me pueda explicar en que estoy mal, ya que pense que tal vez habia que reiniciar apache, pero sigue de la misma forma de antemano gracias....