Ok, ahora he visto la diferencia.Utilizas la siguiente sintaxis para la lista?
<ul>
<li>Uno</li>
<li>Dos</li>
<li>Tres</li>
</ul>
Podrias poner el codigo y ver lo que se puede hacer. IE siempre da problemas.
También te dejo un link interesante de listas y css que te puede ayudar:
maestrosdelweb
Un saludo