como se instala el motor de BD SQL Server

[Myakire]

Si mal no recuerdo, cuando haces el instalador en visual estudio (¿estas usando .NET?) can solo marcar la casilla de SQL Server Express en el asistente del instalador, te copia el SQL en el mismo ejecutable.

Ahora, lo que puedes hacer son dos cosas:

1) Creas un proyecto instalador que revise que exista el motor, genere las tablas y las poble de algún archivo que tengas en el CD de instalación (no se exactamente como se haga pero en codeprojects hay ejemplos básicos)
2) Creas en el mismo ejecutable de tu aplicación una llamada a algún proceso (bat o interno de la aplicación) que sea quien haga lo del punto uno, con la certeza que ya tendras el SQL Express instalado en el PC del cliente, ya que lo seleccionaste al momento de crear el instalador como pre-requisito (menos elegante que la primera opción, pero más sencillo).

Saludos