El problema de muchas tiendas virtuales nuevas es que no disponen de los fondos para armar una estructura contable y legal y entonces fracasan.
Mi consejo es que crees una empresa nueva en una zona libre de impuestos y que esta empresa sea la dueña de tu tienda virtual. De ese modo te ahorras las complicaciones contables locales.
Luego podes tributar en españa el impuesto a las ganancias personales, supongo.
Algunos recursos que te van a servir para tu tienda:
1. Para abrir la empresa en una zona libre de impuestos
www.activefilings.com
2. Para montar la tienda virtual
El Carro de compras Comersus listo en español
3. Para cobrar sin pagar contratos ni importes de transaccion altos
www.paypal.com