Mi primer Gran proyecto. Ayuda plis

[vevni]

mira la web es relativamente nueva en cuanto a diseño y paginas webs asi que no hay nada escrito..... todo es a base de experiencia, quizas unos te recomienden algo y algunos otras formas de hacerlo, pero todos apuntan alo mismo...

puedes mantener tus scripts en unas carpetas, tus imagenes en otra, tus css en otras, y el que la unica entrada sea el index, ya de ahi tu controlas todo lo demas, de tal forma que restrinjas los accesos a las demas carpetas y paginas, tanto por medio de los permisos+sessiones+redirecciones+.htaccess, saber en todo momento que entra y sale, y que caminos por los que deben ir tus usuarios o asi debes planearlo, no abras demasiados puntos de entrada para tu web, mientras mantengas control y sepas que se mueve en tu web, tendras bajo control todo, puedes usarte codigos de php basicos para bitacoras, puedes resetear las sessiones por tiempo, usar encriptacion, hashes, o con los mod_rewrite para que las url sean mas limpias,
tienes un universo, etc
mail
public_ftp
public_html
tmp
www

esas carpetas son las del server, tu contenido tiene que ur en public_html

puedes poner el codigo php arriba de public_html para que no sea accedido desde fuera,
tambien existe una confg en el .ini para establecer el ambito sobre el que php trabajara, como puedes ver hay miles y una formas, te di la direccion de videotutoriales se ve que nisiquiera le hechaste un lente,