Problemas: M-jpeg -> AVI

[Adidas_Boy]

hola a todos, espero k me ayuden en mi duda, uso el software de grabacion Axis Camera Station, el cual que me genera archivos cada media hora, en 1 dia serian alrededor de 48 archivos, y al mes bueno echenle calculadora, ahora para convertir esos archivos a AVI se puede mediante el programa pero son 48 archivos al menos por dia con lo cual es muy tedioso, checando los archivos generados de grabaciones estos vienen en 3 partes. Un archivo jpeg que es la toma previa del archivo, Un archivo X.media que es el mas grande, y uno .metadata que segun investigué es donde vienen datos para que el programa reconozca detalles de la grabacion, lo que necesito es un programa que convierta estos archivos a AVI pero en masa, y no uno por uno como lo hace el programa.

espero me ayuden, esto de hacer miles de clics ya me desesperó.