Bien, no te hace falta usar el partition magic.
Eso es para el caso en que tenés una sola partición, toda utilizada por windows, y querés dividirla "en caliente".
Es muy arriesgado, lo hace sin garantías.
En tu caso, tenés dos discos, y supongo que vas a destinar todo el disco de 4 gb para Linux.
Te recomiendo que las particiones las hagas con el programa de instalación de Linux.
Arrancá la instalación y OJO
elegí "CUSTOM" porque si elegís "STANDARD" te hace pelota todas las particiones y te destina todo el espacio de todos los discos para Linux.
En una parte de la instalación te da la opción de definir las particiones (Si elegiste "CUSTOM") y allí definís una tipo SWAP, del doble de la ram.
En cuanto a utilizar FAT32, no te lo recomiendo, a menos que quieras desde DOS poder accederla.
Si lo hacés para aprender, definí tres particiones, la SWAP, una tipo Linux Standard y por fin otra pequeña (algunos cientos de megas) tipo FAT32, todas en el disco de 4GB
Suerte ;)