una opción sería hacerlo a manita con foreach
Código:
$orden = array();
foreach($linea as $l)
{
//$orden[$l['clase']] = (empty($orden[$l['clase']]) ? 0 : $orden[$l['clase']];
$orden[$l['clase']] += $l['cantidad];
}
creo que eso es lo que necesitas. Si por alguna razón no funciona tal como está, descomenta la linea // y asunto arreglado. Esperemos que no sea necesaria.
Saludos