mmm que yo sepa, no hay ningún problema ti tu pones saltos de linea en una variable en JavaScript, así que tu problema puede estar en otro lado.
JavaScript se delimita (al igual que PHP) con ; asi que tu puedes hacer esto sin problema:
Código:
var texto = 'aafsd
sadfsa
asdfsafs
sfdasfd
asfdas';
Y se ejecuta sin problemas.
Saludos.