La puedes rescatar con el formato que quieres atravez de una instruccion SQL, creas un alias para el nuevo dato(con nuevo formato) nfecha
Código PHP:
$consulta = "SELECT DATE_FORMAT(fecha,'%d-%m-%Y') AS nfecha FROM tabla";
$result = mysql_query( $consulta, $conex) or die ( mysql_error() );
$dato = mysql_fetch_array( $result );
echo $dato['nfecha'];
Tambien lo puedes hacer con funciones PHP por ejemplo
Código PHP:
$nfecha = date("d-m-Y", $row['fecha']);
Donde $row['fecha'] es el resultado que sacas de tu array de consulta
Saludos.