A las funciones de los popups, añadeles otra instruccion. Un return false; o un window.focus(); o lo que quieras.
Si enlazas a un window.open() a secas, se abre una ventana nueva y, en la vieja, pone [object], por eso hay que poner alguna función tonta más o hacer el enlace con un onclick :P
<font size=2>Proximamente...
<a href="http://www.traduim.com">Traduim</a>: El portal de los traductores[/CODE]