mysql y win 98

[BrujoNic]

Disculpa, pero sigo sin comprender... ¿Donde entra en función MySQL?
Estas usando un programa en JAVA el cual se conecta por ODBC o por lo que sea a otro equipo con MySQL, es así o no?

Debes recordar que el problema es tuyo y si no sabes explicarte, no vamos a poder ayudarte.

¿Donde está instalado MySQL? ¿En el win98 o en otro equipo?
¿Cómo estas tratando de conectarte (esto ya no es mysql, es programación) por odbc, alguna librería o función de JAVA?

Si estas seguro que es de MySQL, ¿Dónde esta tu consulta propiamente de eso?

Apertura de puertos, no es mysql, es permisos.
Conexión, no es mysql, es el método o medio de conexión que vas a usar para conectarte a cualquier motor de BD y por lo tanto, no es MySQL.
Java, no es MySQL.

Por favor, trata de ser lo más claro posible (paso a paso) de lo que necesitas y de esa manera orientarte moviendo tu mensaje a la sección respectiva o dejarla aquí.