Bueno, ya lo he solucionado:
Código PHP:
$db = conectarse();
$lista=$_POST['sel'];
foreach ($lista as $id){
$lista2=$lista2."'".$id."',"; // añado comillas simples a cada variable q contiene el array los separo con comas.
}
$lista2=substr ($lista2, 0, -1); //elimino la última coma
$nouEstat="Inactiu";
$cons="UPDATE lectors SET Estat='$nouEstat' WHERE Perfil IN(".$lista2.")"; //hago la consulta
Esto ha funcionado, y no se si es una chapuza, y si se podria mejorar.
Gracias