Usa así tu código:
Código PHP:
<td class="enlace" align="center" valign="top"><input type="checkbox" name="chboxnumfactura[<?=$con;?>]" id="chboxnumfactura[<?=$con;?>]" value="<?=$registro["numfactura"]?>" onclick="seleccionarNumFactura(this.value,'<?=$con? >);"></td>
Saludos.