Una compañera encontró la solución. La pongo por si alguien tiene alguna vez el mismo problema.
Es la configuración del puerto, se solucionó con el comando linux siguiente:
Código:
stty crtscts -ixon -ixoff -ixany -echoctl clocal -isig -icanon -echo -echoe iexten ignbrk< /dev/ttyS0