Buenas,
A mi me a sobresaltado también el echo de que en Webmastertools de Google hayan desaparecido los enlaces externos que había cosechado durante estos últimos meses en uno de las páginas que administro... No obstante, sigue manteniendo las mismas posiciones (más o menos) estables que presentaba antes.
Quizás tan solo sea una cuestion de "reajustes" internos por parte de Google. A saber, de heco actualmente si consulto los vinculos externos aparece la siguiente información:
Cita: En los enlaces externos dirigidos a su sitio
La información no está disponible en estos momentos.
Por lo que entiendo, que quizás tan solo sea una cuestión de "actualización" por parte de Google.
Yo no me alarmaría por el momento, deja que pasen un par de días a ver como evoluciona el tema. No obstante, si lo que quieres saber es si Google te ha penalizado, hay herramientas online que te informan de este hecho, aunque puede que las mismas no sean 100% fiables:
http://cuwhois.com/herramienta-seo-baneado-google.php
Saludos