PHP incrustado en HTML...pros y contras

[vega22]

Ajá...un Smarty y esas cosas...Bueno, no tengo ni idea de cómo trabajar con eso aún. Todo lo hago "a pelo". Lo tendré en cuenta para los próximos proyectos. Como para lo que está ya acabado me da pereza cambiarlo tanto (todo lo nuevo se hace un mundo), voy a tratar de formatear los scripts ya listos de la manera más correcta posible, sin meterme en plantillas, ya que en realidad lo que básicamente necesito es algo tan simple como ponerle Doctype y charset a todos los sripts, cosa que ya estaría hecha si no fuera por los headers locations. Por otro lado, me parece que quizás sea una tontería innecesaria formatear en (x)html unos scripts que sólo hacen procesado y envian debugs de la mysql y esas cosas. No sé...
¿Tú qué harías? formatear xhtml y cambiar los location por, por ejemplo, echos ("<href....), o dejarlos tal y como están, como scripts de procesado plano?