Simplemente:
Esta sentencia no solamente elimina todos los datos de la tabla sino que reinicia el campo auto_increment.
Atención: Las tablas MyISAM deben ser reiniciadas manualmente: Debes buscar en information_schema.`TABLES`.`AUTO_INCREMENT` donde information_schema.`TABLES`.`TABLE_NAME` contenga el nombre de la tabla buscada y ponerlo en 0