Open Source:
http://www.prestashop.com/ Joomla Shopping Carts (
http://virtuemart.net/)
Bueno OsCommerce es de los más utilizados, fácil de instalar, buenas utilidades, templates, etc.
PD: Nuna he probado Joomla Shopping, pero creo que es bueno, porque sé que encontrarás mucho sobre esto.
saludos,