Coloque en el do while ponga condiciones. Algo asi como:
Código PHP:
/* Antes del do debe inicializar una varible */
$EstNoticias = 1
/* Dentro del do hace*/
if (($Estnoticias%3) == 0)
{
//imprimir horizontalmente
}
else
{
// imprimir Verticalmente.
}
$EstNoticias = $EstNoticias + 1;
Eso es solo una idea ya usted adapta la condicion dependiendo sus necesidades.
Suerte y espero le sirva